事宜为名来上海,实际上带着袁世凯招安共进会的秘密使命,与应桂馨建立联系与交情。洪述祖不仅向江苏都督程德全举荐应桂馨出任江苏驻沪巡查长,还说服黎元洪取消了对应桂馨的通缉。
十二月应桂馨受洪述祖之邀北上北京,谒见大总统袁世凯与国务.总.理赵秉钧,期间曾请求任命他为“中央特派驻沪巡查总长”,管辖自川、豫以至闽、广等地的会党势力,被赵秉钧拒绝,
当时,洪述祖欲阻止国民党组建政党内阁,在袁世凯的支持下密电联络应桂馨,要求他搜集关于国民党领袖孙中山、黄兴、宋教仁的黑材料。应桂馨谎称他已得知日本有“孙黄宋劣史”、“黄与下女合像”、“宋犯骗案刑事提票”等物证,向政.府索要30万来购买。袁世凯对“宋犯骗案刑事提票”颇感兴趣,欲知其详情并托洪述祖要求应桂馨先提供原件或影印件,但应桂馨始终无法交出。
一个常见的说法是,洪述祖知道妖魔化国民党要人的方法行不通后,便于三月六日密电应桂馨,暗示他对宋教仁“乘机下手”。十三日更以“毁宋酬勋位”为诱饵,嗾使应桂馨杀害宋教仁。应桂馨欲以低价收购国债作为报酬,洪述祖则回应“债票特别准”。
应桂馨得到承诺后,收买凶手武士英,于一九一三年三月二十日制造了宋教仁案。三月二十四日,应桂馨在迎春坊妓女李桂玉家中被英捕房逮捕。在审判期间百般抵赖,至七月二次革命爆发之际,他趁乱越狱,藏身青岛德国租界。
据称,二次革命遭镇压、袁世凯就任正式大总统后,应桂馨致电政.府,称自己杀“贼”有功,请求平冤昭雪。袁世凯政.府并无反应,他便亲自入京邀赏。在北京期间,每晚在八大胡同纵情声色。
一九一四年一月十七日,应桂馨在嫖娼并吸大烟时遇到军警查拿。军警不知他为应桂馨,他却高声对军警说:“我乃民国首功,又杀宋教仁之功首,现在**将予我上将,并酬勋位及国库证券百万,今我逸兴遄发,乐此以消永夕,于汝何事?”遂将军警轰走。
两天后的一月十九日下午,应桂馨就在津京快车上遇刺身亡,主使者一般认为是袁世凯。
对于涉及到自己的电报,赵秉钧辩称:“程都督、应民政长宣布宋案证据,其涉及秉钧者,惟手书两件,然一为发给密码,一为请领津贴,均属因公”。
宋教仁案的另一个重要嫌犯是国府的内务部秘书洪述祖。
洪述祖,原名洪熙,字荫之,号观川居士,出生于江苏常州一个名门望族之家。他的先祖是清代赫赫有名的大文豪洪亮吉。其名述祖,有继先祖功业之意。不过,洪述祖一生行迹与乃祖之行,南辕北辙。
洪述祖九个月时,太平军攻陷常州,其父洪彦先死于巷战,家属十七人投河。唯洪述祖与其母张氏被人所救。后依靠叔父洪彦哲生活,并在其门下受学。
光绪四年(1878年)考取秀才,但其后八年间屡试不第,于是以游幕为生。先后佐理江西学政陈宝琛、江西巡抚潘霨、钦差大臣督办福建军务左宗棠和台湾巡抚刘铭传之幕府。
光绪十四年(1888年),洪述祖被刘铭传派去英国,验收台湾商务局在英国订造的“驾时”、“斯美”两艘快船。事后刘铭传弹劾洪述祖私吞公款,遂被革职并下淡水县狱。
光绪十九年(1893年),洪述祖出狱,北上天津投奔同乡津海关道盛宣怀。不久甲午中日战争爆发,洪述祖被派往朝鲜,负责电报事务,并在那里结识了袁世凯、唐绍仪。战后洪述祖回江苏谋生,从此其名由洪熙改为洪述祖,并入余联沅之幕府。
光绪二十八年(1902年)秋,清廷重新起用洪述祖,以候选知县分发湖北。在汉口任职两年多,历任汉口清丈局坐办、汉口厘局交涉文案兼办鄂中洋务交涉、汉阳府夏口厅发审委员、汉口警察第二局总办等职。
光绪三十一年(1905年)春因与江汉关道继昌不和,洪述祖辞职,重返上海,协助李经方办理安徽铁路事宜。
光绪三十三年(1907年)被选拔到直隶任职,历任全省水利总局会办、洋务局会办、印花税局会办、度量权衡局会办等多个差使。一年试用期满后,直隶总督杨士骧给他的评语是“精明干练,颇知大体,堪为优等”,奏请留省补用。